Uganda isännöi vanhin yliopisto Itä-ja Keski-Afrikassa, joka on Makereren yliopisto. Tämä yliopisto on ollut keskus akateemista huippuosaamista vuosikymmeniä paitsi ugandalaisista opiskelijoita, mutta myös muiden opiskelijoiden alueella. Uganda on yli 30 julkisten yliopistojen.

Liiketoimintajohtamisen maisterin tutkinto (master of business administration, MBA) on ammatillinen tutkinto, joka myönnetään liikkeenjohtoa kauppakorkeakoulussa opiskelleille. Opintoihin kuuluu erilaisia analysointiin ja strategiaan liittyviä kokonaisuuksia, ja niissä perehdytään muun muassa markkinointiin, rahoitusalaan ja laskentatoimeen.